Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms