Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phtf1Q9QZ09 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phtf1Q9QZ09 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phtf1Q9QZ09 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phtf1Q9QZ09 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phtf1Q9QZ09 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phtf1Q9QZ09 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms