Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms