Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms