Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Capn12Q9ER56 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms