Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms