Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp4Q9DBY0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms