Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15614-201ENSMUST00000155976 1537 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm18200-201ENSMUST00000173265 833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm18190-201ENSMUST00000174801 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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