Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnpy3Q9DAU1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms