Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms