Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms