Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms