Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms