Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18l2Q9D174 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms