Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms