Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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