Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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