Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms