Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms