Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Brms1Q99N20 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms