Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms