Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms