Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp5lQ99LH9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bp5lQ99LH9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms