Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pagr1aQ99L02 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms