Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdgfdQ925I7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms