Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms