Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf4Q8R368 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf4Q8R368 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms