Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc12Q8K2L8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc12Q8K2L8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc12Q8K2L8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc12Q8K2L8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc12Q8K2L8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc12Q8K2L8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trappc12Q8K2L8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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