Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms