Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FgbQ8K0E8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FgbQ8K0E8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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