Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit1Q8K099 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit1Q8K099 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit1Q8K099 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit1Q8K099 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit1Q8K099 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit1Q8K099 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms