Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms