Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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