Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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