Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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