Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc15Q8C9M2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc15Q8C9M2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc15Q8C9M2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc15Q8C9M2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc15Q8C9M2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms