Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms