Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp38Q8BW70 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp38Q8BW70 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms