Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BP99 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8BP99 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8BP99 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8BP99 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8BP99 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms