Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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