Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms