Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms