Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrc2bQ7TPM1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms