Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp397Q7TNK4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms