Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms