Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rcbtb1Q6NXM2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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