Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca2Q6DIC0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms