Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kiaa1549Q68FD9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms