Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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