Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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